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上沼と下沼の二つの沼から成っています。もとは一つの沼だったのですが、宝蓮山真浄寺の「竜宮仏縁記」によると、寛永年間(1624～43)に沼を分割、堤を築いて往還の大道とし、ここを境に上沼と下沼とに分かれたとあり、近江八景になぞられた黒浜八景の名勝の一つに数えられています。上沼周辺の休耕田や湿地には、ヨシやマコモ、ガマなどの湿性植物が生育し、ジョウロウスゲなどの絶滅危惧種も確認されています。その他、昆虫類では、ウチワヤンマなどのトンボ類やアカガネオサムシなどの甲虫類も多数生息しています。また、鳥類、昆虫類の生息密度も高く、人為の影響の少ない地域であり、湖沼特有の生態系を維持しています。